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農科院作科所玉米分子育種創新團隊提出混合樣品分析新策略

    2016年11月03日

    • 上世紀90年代提出的混合分離體分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遺傳學研究上得到廣泛應用。隨著高通量測序和分析技術的發展,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更為廣泛的應用。


          中國農科院作物科學研究所玉米分子育種技術和應用創新團隊鄒棖、王平喜、徐云碧將DNA混池分析方法擴展為具有普遍適用性的混合樣品分析(bulked sample analysis),系統地闡述了適用于混合樣品分析的群體、抽樣和混合策略、標記類型和鑒定平臺、實驗設計原則及分析流程。


          玉米分子育種創新團隊拓展的混合樣品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物種、群體或基因型分析平臺的限制,與物種是否具有參考基因組的無關;既可以應于自然群體中,也可以應用于雙親分離群體;混合樣品分析適合于不同的基因型鑒定平臺,包括單個的分子標記、高密度標記芯片和基于測序的分子標記系統等。混合樣品分析可在不同的分子水平上進行,包括 DNA、RNA和蛋白質。研究人員可以從任何遺傳或育種群體中采集極端個體,分類后進行混合樣品的對比分析,也可以針對僅存的某種極端類型進行混合樣品分析。高通量的基因型鑒定技術與混合樣品分析相結合已經成為快速挖掘優良等位基因及變異、開發重要農藝性狀分子標記的強大工具。混合樣品分析為利用基因組學技術和優異種質資源,挖掘重要農藝性狀基因并應用于作物改良提供了捷徑。


           研究結果以《Bulked sample analysis in genetics, genomics and crop improvement》為題在線發表于《植物生物技術雜志(Plant Biotechnology Journal)》。



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